Президент України Віктор Янукович призначив Марину Ставнійчук заступником глави Адміністрації Президента України. Ставнійчук є членом Венеціанської комісії (Європейської комісії за демократію через право). З 1999 по 2007 рік обіймала посаду заступника голови ЦВК, з червня 2007 року по березень 2010 р. була заступником глави Секретаріату Президента Віктора Ющенка - представником Президента в Конституційному Суді, представником Президента в Центральній виборчій комісії.